شد الحاج أمين رحاله إلى ألمانيا، ووصل برلين في 6/11/1941م، والتقى مع سكرتير وزارة الخارجية ارنست فون فايتسكر،

والتقى أيضا مع وزير الخارجية فون روبنترو، ولكن قمة تلك اللقاءات كانت لقاء المفتي مع هتلر في 28/11/1941م

بدأ المفتي في هذا اللقاء بطلب إصدار تصريح ألماني باستقلال البلاد العربية والموافقة على استئصال الوطن القومي اليهودي

فأكد هتلر للحاج أمين بأن هدفه هو شن حرب لا هوادة فيها ضد اليهود
الأمر الذي سيؤدي طبيعياً إلى تحطيم ما يسمى بالوطن القومي اليهودي

وأكد أن هدفه هو تحطيم الشيوعية واليهودية، وإخراج الإنجليز من الشرق الأوسط

أما بالنسبة للتصريح الذي طلبه الحاج أمين من هتلر، إصدار تصريح باستقلال البلاد العربية

فلم يكن هتلر راغباً في إعطاء مثل هذا التصريح، بحجة انه مجرد تصريح لا قيمه له

وان وقته لم يحن بعد

على أية حال يمكن القول أن الحاج أمين لم يكن يقضي عطلة صيفية أو شهر عسل في ألمانيا على حساب هتلر

بل كان في ألمانيا بدافع الوطنية وحب الوطن

فأنشأ في ألمانيا إدارة سميت "مكتب المفتي"

كان لها نشاطات في العالم كله تقريباً في مجالات أربع هي:

الإذاعة بالمذياع
عمليات فدائية في الشرق الأوسط
تجنيد مسلمي أوروبا وجنوب روسيا في وحدات عربية مسلحة
وتكوين فرق عربية مسلحة من خلال هذه الإذاعة، اتصل الحاج أمين بالشخصيات الإسلامية البارزة في العالم

لكسبها إلى جانب ألمانيا، فاتصل بالمجاهد الهندي فقير آبي يحرضه على الثورة على الإنجليز

ومع تزايد الانتصارات الألمانية في شمال أفريقيا ازداد اهتمام الألمان بالنشاط الألماني الإعلامي الموجه للبلاد العربية، فانشأ في 30/3/1942م مركز الإنباء العربي الذي تولى إدارته الصحفي اللبناني عفيف الطيبي، كما كان المعهد الإسرائيلي المركزي يقوم بترجمة خطب الحاج أمين في المناسبات العربية والإسلامية، ونشرها بالألمانية
لكن هذا الوضع لم يستمر طويلاً، حيث بدأت ألمانيا تخسر الحرب تدريجياً، فحاول الحاج أمين الهرب إلى سويسرا، غير أن السلطات الفرنسية رفضت السماح له بالإقامة، فحاول العبور إلى فرنسا، ولكن الفرنسيين القوا القبض عليه، وفرضوا عليه الإقامة الجبرية ولكنهم لم يسلموه للإنجليز كمجرم حرب، بسبب هروبه إلى القاهرة عام 1946م بواسطة جواز سفر مزيف، وبقي هناك حتى نهاية الانتداب البريطاني على فلسطين